CICLO DE KREBS

El ciclo del ácido cítrico, se refiere a la primera molécula que se forma en las reacciones del ciclo: citrato o, en su forma protonada, ácido cítrico. Sin embargo, es posible que escuches que esta serie de reacciones se llame ciclo de los ácidos tricarboxílicos (TCA), por los tres grupos carboxílicos de los primeros dos intermediarios, o el ciclo de Krebs, por su descubridor, Hans Krebs. 

Como sea que prefieras llamarlo, el ciclo del ácido cítrico es una pieza central de la respiración celular. Toma acetil $\text{CoA}$start text, C, o, A, end text—producida por la oxidación del piruvato y derivada originalmente de la glucosa— como su materia prima y, en una serie de reacciones redox, recolecta gran parte de la energía de sus enlaces en forma de moléculas de $\text{NADH}$start text, N, A, D, H, end text, $\text{FADH}_2$start text, F, A, D, H, end text, start subscript, 2, end subscript y $\text{ATP}$start text, A, T, P, end text. Los acarreadores de electrones reducidos —$\text {NADH}$start text, N, A, D, H, end text y $\text{FADH}_2$start text, F, A, D, H, end text, start subscript, 2, end subscript— generados en el ciclo de los ácidos tricarboxílicos pasarán sus electrones a la cadena de transporte de electrones y, mediante fosforilación oxidativa, generarán la mayor parte del ATP producido en la respiración celular.

En eucariontes, el ciclo del ácido cítrico tiene lugar en la matriz de la mitocondria al igual que la conversión del piruvato en acetil-$\text{CoA}$start text, C, o, A, end text (en procariontes, todos estos pasos suceden en el citoplasma). El ciclo del ácido cítrico es un circuito cerrado de ocho etapas principales en el que la última parte de la vía regenera la molécula utilizada en el primer paso.

Diagrama simplificado del ciclo del ácido cítrico. Primero, el acetil-CoA se combina con oxalacetato, una molécula de cuatro carbonos, con lo que se libera la molécula de CoA y se obtiene el citrato, una molécula de seis carbonos. Después de que el citrato se somete a un paso de rearreglo, pasa por una reacción de oxidación y transfiere electrones a una molécula de NAD+, con lo que se obtiene una molécula de NADH y se libera una de dióxido de carbono. La molécula de cinco carbonos resultante se somete a una segunda reacción de oxidación, en la que se transfieren electrones a una molécula de NAD+ y se obtiene NADH junto con la liberación de dióxido de carbono. La molécula de cuatro carbonos que resulta pasa por una serie de transformaciones, durante las cuales el GDP y el fósforo inorgánico se convierten en GTP—o, en algunos organismos, el ADP y el fósforo inorgánico se convierten en ATP—, una molécula de FAD se convierte en FADH2 y otro NAD+ se convierte en NADH. Al final de esta serie de reacciones, la molécula inicial de cuatro carbonos, el oxalacetato, se regenera, lo que permite que el ciclo vuelva a comenzar.

En el primer paso del ciclo, el acetil $\text{CoA}$start text, C, o, A, end text se combina con una molécula aceptora de cuatro carbonos, el oxaloacetato, para formar una molécula de seis carbonos llamada citrato. Después de un rápido rearreglo, esta molécula de seis carbonos libera dos de sus carbonos como moléculas de dióxido de carbono en un par de reacciones similares, a la vez que produce una molécula de $\text{NADH}$start text, N, A, D, H, end text en cada ocasión $^1$start superscript, 1, end superscript. Las enzimas que catalizan estas reacciones son reguladores clave del ciclo del ácido cítrico y lo aceleran o desaceleran según las necesidades energéticas de la célula$^2$squared.

La molécula de cuatro carbonos resultante se somete a una serie de reacciones adicionales: primero, se genera $\text{ATP}$start text, A, T, P, end text —o, en algunas células, una molécula similar llamada $\text{GTP}$start text, G, T, P, end text— luego se reduce el acarreador de electrones $\text{FAD}$start text, F, A, D, end text en $\text{FADH}_2$start text, F, A, D, H, end text, start subscript, 2, end subscript y, por último, se genera otra molécula de $\text{NADH}$start text, N, A, D, H, end text. Este conjunto de reacciones regenera la molécula inicial, oxalacetato, con lo que el ciclo puede repetirse.

En general, una vuelta del ciclo del ácido cítrico libera dos moléculas de dióxido de carbono y produce tres $\text{NADH}$start text, N, A, D, H, end text, un $\text{FADH}_2$start text, F, A, D, H, end text, start subscript, 2, end subscript y un $\text{ATP}$start text, A, T, P, end text o $\text{GTP}$start text, G, T, P, end text. El ciclo del ácido cítrico ocurre dos veces por cada molécula de glucosa que entra en la respiración celular, porque se obtienen dos piruvatos (y, por lo tanto, dos acetil-$\text{CoA}$start text, C, o, A, end text) por glucosa.

Pasos del ciclo del ácido cítrico

Paso 1. En el primer paso del ciclo del ácido cítrico, el acetil-$\text{CoA}$start text, C, o, A, end text se une con una molécula de cuatro carbonos, oxalacetato, y libera el grupo $\text{CoA}$start text, C, o, A, end text a la vez que forma una molécula de seis carbonos llamada citrato.

Paso 2. En el segundo paso, el citrato se convierte en su isómero isocitrato. En realidad, este es un proceso de dos pasos en el que primero se retira una molécula de agua que luego se vuelve a añadir; por eso, a veces describen al ciclo del ácido cítrico como una vía de nueve pasos en lugar de los ocho que aquí enlistamos$^3$cubed.

Paso 3. En el tercer paso, el isocitrato se oxida y libera una molécula de dióxido de carbono, con lo que queda una molécula de cinco carbonos (el α-cetoglutarato). Durante este paso $\text{NAD}^+$start text, N, A, D, end text, start superscript, plus, end superscript reduce a $\text{NADH}$start text, N, A, D, H, end text. La enzima que cataliza este paso, la isocitrato deshidrogenasa, es un importante regulador de la velocidad del ciclo del ácido cítrico.

Paso 4. El cuarto paso es similar al tercero. En este caso, es el α-cetoglutarato que se oxida, lo que reduce un $\text{NAD}^+$start text, N, A, D, end text, start superscript, plus, end superscript en $\text{NADH}$start text, N, A, D, H, end text y en el proceso libera una molécula de dióxido de carbono. La molécula de cuatro carbonos resultante se une a la coenzima A y forma el inestable compuesto succinil-$\text{CoA}$start text, C, o, A, end text. La enzima que cataliza este paso, α-cetoglutarato deshidrogenasa, también es importante en la regulación del ciclo del ácido cítrico.

Diagrama detallado del ciclo del ácido cítrico que muestra las estructuras de varios intermediarios del ciclo y las enzimas que catalizan cada paso.

Paso 1. El acetil-CoA se combina con el oxalacetato en una reacción catalizada por la citrato sintasa. Esta reacción utiliza un molécula de agua como reactivo y libera una molécula de CoA-SH como producto.

Paso 2. El citrato se convierte en isocitrato en una reacción catalizada por la aconitasa.

Paso 3. El isocitrato se convierte en α-cetoglutarato en una reacción catalizada por la isocitrato deshidrogenasa. Una molécula de NAD+ se reduce a NADH + H+ durante la reacción y se libera una molécula de dióxido de carbono como producto.

Paso 4. El α-cetoglutarato se convierte en succinil-CoA en una reacción catalizada por el α-cetoglutarato deshidrogenasa. Una molécula de NAD+ se reduce a NADH + H+ durante la reacción, en la cual se utiliza CoA-SH como reactivo, y se libera una molécula de dióxido de carbono como producto.

Paso 5. La succinil-CoA se convierte en succinato en una reacción catalizada por la enzima succinil-CoA sintasa. Esta reacción convierte al fosfato inorgánico (Pi) y al GDP en GTP a la vez que libera el grupo CoA-SH.

Paso 6. El succinato se convierte en fumarato en una reacción catalizada por la succinato deshidrogenasa. El FAD se reduce a FADH2 en esta reacción.

Paso 7. El fumarato se convierte en malato en una reacción catalizada por la enzima fumarasa. Esta reacción utiliza una molécula de agua como reactivo.

Paso 8. El malato es convertido en oxaloacetato en una reacción catalizada por la malato deshidrogenasa. Esta reacción reduce una molécula de NAD+ a NADH + H+.

Paso 5. En el quinto paso, la $\text{CoA}$start text, C, o, A, end text de la succinil-$\text{CoA}$start text, C, o, A, end text se sustituye con un grupo fosfato que luego es transferido a $\text{ADP}$start text, A, D, P, end text para obtener $\text{ATP}$start text, A, T, P, end text. En algunas células se utiliza $\text{GDP}$start text, G, D, P, end text (guanosín difosfato) en lugar de $\text{ADP}$start text, A, D, P, end text, con lo que se obtiene $\text{GTP}$start text, G, T, P, end text (guanosín trifosfato) como producto. La molécula de cuatro carbonos producida en este paso se llama succinato. 

Paso 6. En el sexto paso se oxida el succinato y se forma otra molécula de cuatro carbonos llamada fumarato. En esta reacción se transfieren dos átomos de hidrógeno (junto con sus electrones) a $\text{FAD}$start text, F, A, D, end text para formar $\text{FADH}_2$start text, F, A, D, H, end text, start subscript, 2, end subscript. La enzima que realiza este paso se encuentra incrustada en la membrana interna de la mitocondria, por lo que el $\text{FADH}_2$start text, F, A, D, H, end text, start subscript, 2, end subscript puede transferir sus electrones directamente a la cadena de transporte de electrones. 

Paso 7. En el séptimo paso se le añade agua a la molécula de cuatro carbonos fumarato, con lo que se convierte en otra molécula de cuatro carbonos llamada malato.

Paso 8. En el último paso del ciclo del ácido cítrico, se regenera el oxalacetato (el compuesto inicial de cuatro carbonos) mediante la oxidación del malato. En el proceso, otra molécula de $\text{NAD}^+$start text, N, A, D, end text, start superscript, plus, end superscript se reduce a $\text{NADH}$start text, N, A, D, H, end text.

Los productos del ciclo del ácido cítrico

Regresemos un poco para hacer cuentas y seguir el camino de los carbonos que entran al ciclo del ácido cítrico y calcular la producción de $\text{ATP}$start text, A, T, P, end text y acarreadores de electrones reducidos ($\text{NADH}$start text, N, A, D, H, end text y $\text{FADH}_2$start text, F, A, D, H, end text, start subscript, 2, end subscript).

En una sola vuelta del ciclo,

• entran dos carbonos del acetil-$\text{CoA}$start text, C, o, A, end text y se liberan dos moléculas de dióxido de carbono;
• se generan tres moléculas de $\text{NADH}$start text, N, A, D, H, end text y una de $\text{FADH}_2$start text, F, A, D, H, end text, start subscript, 2, end subscript; y
• se produce una molécula de $\text{ATP}$start text, A, T, P, end text o $\text{GTP}$start text, G, T, P, end text.

Estas cifras son para una vuelta del ciclo, que corresponde a una molécula de acetil $\text{CoA}$start text, C, o, A, end text. Cada glucosa produce dos moléculas de acetil $\text{CoA}$start text, C, o, A, end text, por lo que debemos multiplicar estas cifras por $2$2 si queremos conocer el rendimiento por glucosa.

En cada vuelta entran dos carbonos (del acetil-$\text{CoA}$start text, C, o, A, end text) al ciclo del ácido cítrico y se liberan dos moléculas de dióxido de carbono. Sin embargo, las moléculas de dióxido de carbono no contienen carbonos del acetil-$\text{CoA}$start text, C, o, A, end text que acaba de entrar al ciclo. En su lugar, los carbonos del acetil-$\text{CoA}$start text, C, o, A, end text se incorporan inicialmente a los intermediarios del ciclo y se liberan como dióxido de carbono hasta en ciclos posteriores. Después de suficientes vueltas, todos los carbonos del grupo acetilo del acetil-$\text{CoA}$start text, C, o, A, end text se liberan como dióxido de carbono.

¿Dónde está todo el $\text{ATP}$start text, A, T, P, end text?

Puedes estar pensando que la producción de $\text{ATP}$start text, A, T, P, end text del ciclo del ácido cítrico es casi insignificante. ¿Todo ese trabajo solo para un $\text{ATP}$start text, A, T, P, end text o $\text{GTP}$start text, G, T, P, end text?

Es cierto que el ciclo del ácido cítrico no produce mucho $\text{ATP}$start text, A, T, P, end text directamente. Sin embargo, puede hacer muchísimo $\text{ATP}$start text, A, T, P, end text indirectamente por el $\text{NADH}$start text, N, A, D, H, end text y el $\text{FADH}_2$start text, F, A, D, H, end text, start subscript, 2, end subscript que genera. Estos acarreadores de electrones conectarán con la última parte de la respiración celular, al depositar sus electrones en la cadena de transporte de electrones para impulsar la síntesis de moléculas de ATP mediante la fosforilación oxidativa.

 Bilbliografia complementaria: https://es.slideshare.net/cervantesalondra/ciclo-de-krebs-72369605